Las moscas son consideradas una plaga porque suponen un riesgo para la salud de personas y animales. Pueden contaminar hogares y negocios y son portadoras de enfermedades como Salmonella y E.coli. 

Algunas especies incluso pueden llegar a picar. La presencia de fuentes de alimentación facilita el establecimiento de colonias de moscas. Los periodos lluviosos seguidos de olas de calor aceleran el ciclo de vida de las moscas.

 El manejo inadecuado o evasión de protocolos productivos constituye una base para la diseminación de plaga de moscas.